经过如此层层挑选之后，福建省军事单位的作战能力，没有丝毫减弱，反而战力大涨，各级城防部队的军事素质也有所提高。这里练兵的同时，杨齐还从赵英杰处抽掉了一大批的训练员，前往福建的城防军营区对他们进行军事化训练，为期三个月！并且以后每年都要进行考核，哪个城防军的训练不达标，将扣发该营主官的半年俸禄，其他将官扣发三个月的俸禄，全营士兵的训练周期则从原来的三个月，延长到为期半年的军事强化训练。

这一条条军事命令下发到基层单位之后，城防军原本还有些不满，可当看到就连千户都被裁撤的时候，顿时没了声音，不等赵英杰的训练员抵达，自己就开始带领部队操练起来，一时间福建全省各地都在大练兵，武备风气披靡。

最主要的是因为杨齐这个鹰派战将出身的总督，特别在乎军队的装备，各级军官申报的军服、武器、装备、补给等等一路绿灯，原本各级衙门都要克扣的，随着军队大换血，裁撤雷厉风行的档口，居然没有一个官员敢于触碰杨齐的霉头，为此总督府花费了高达三百万两白银，给整个福建武装人员换装，这也难怪，好多城防军的军服都是补了又补，犹如乞丐服，这次换装，每人下发了最少十二套军服，这里面包括了冬夏两季的作训服、战斗服以及常服各两套，给这些当兵高兴坏了，而且自从杨齐到任之后，这饷银从来就没有拖欠过，所以尽管杨齐对部队要求严格，而士兵却反而感觉温暖，因为自己终于有了归属感！再也不是爹不亲娘不爱的主儿了。

福建的军政改革是在剿匪结束之后，军队携军功之势而来，不到两个月，就完成了十五万人的整编，包括后续的分流、安置等问题，第三个月，再入冬前就开始军事化训练。

杨齐预计在明年的上半年，把福建的新军拉到京城，给皇帝陛下检阅，以达到在全国范围内推广新军的目的，一旦这个目标达成，明朝的战斗力将会大大提高，如果女真人再敢来犯的话，必将打得他们屁滚尿流。

福建的军事改革完成之后，就是民政方面的官员考核，杨齐已经开始着手办理，这里需要户部、吏部、礼部甚至是内阁多个部门联动，考核标准分为：刑事案件、民事案件、财政收入、地方发展、规划、城市整洁等等多个方面进行，很多问题都是这些官员不曾面对的，但又都是确实发生在他们辖区内、且属于其工作范畴的。

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