杀害杨虎城等人之后，杨钦典又带人毁尸灭迹，把尸体拖到后山，浇上汽油焚烧，只剩下尸骸时才挖坑掩埋。这是集中营一贯做法，为解放后辨认烈士遗骸造成巨大障碍，但人民公安不畏艰难，日以继夜工作，依然辨认出大部分遗骸，以此告慰惨死在敌人狱中的革命志士。

距离大屠杀既定时间越来越近，杨钦典心知肚明，此时不逃更待何时？这时候他干了一件大事：吩咐最得力的两个手下在大屠杀开始前，把暗杀名单上的第一批人员从密道带走。然后借口下山买烟，换上便装，悄悄离开歌乐山，回家揣上侯丹青所赠钱财和船票，连夜乘船前往武汉，又从上海奔赴香港，躲藏了大半年年才返回重庆。

杨钦典最后的结局是什么呢？1949年11月30日下午，重庆解放后第二天，在罗广斌的劝说下，杨钦典到重庆市公安局登记自首。政府根据罗广斌等人证言，证实其在关键时刻“将功补过”，对其宽大处理不予追究，还准备把他安排在重庆市公安局工作。杨钦典表示想家，政府根据他的意愿，发了路费，让他平安离开重庆。

文革中，重庆市公安局宣布“逮捕国民党特务杨钦典”，杨钦典因历史问题被判刑20年，关押在四川省第一看守所。1982年，重庆市中级人民法院重审查明：杨钦典在解放前任白公馆看守员期间犯有严重罪行，但在解放前夕的大屠杀中，他曾经解救革命志士10余人，有立功表现，对其逮捕判刑予以纠正，撤销判决，不予追究。杨钦典释放后回河南老家务农。

2004年11月27日晚，在白公馆和渣滓洞，重庆市为“1127大屠杀”殉难烈士举行盛大而隆重的悼念活动。第二天，重庆的多家媒体都报道了这样一个场景：86岁高龄的杨钦典蹲在墓碑前，老泪纵横地为已故先烈们焚烧冥钞。2007年11月17日，杨钦典病逝于河南省源汇区大刘镇周庄村，终年89岁。