在得知暗物质联盟的险恶计划后，联合舰队全力以赴地准备应对这场关乎宇宙存亡的决战。他们深知，现有的力量或许不足以抗衡敌人，因此将升级进化生产线的工作提升到了最高优先级。

联合舰队投入了大量的资源和顶尖的科学家，生产线开始了全方面的进化。新的生产线采用了超维度物质转换技术，能够在极短的时间内制造出先进且强大的武器装备。同时，生产线还具备了自我修复和优化的能力，能够根据战斗中的实际需求进行即时调整。

在火力方面，联合舰队也取得了重大突破。他们研发出了一种名为“星辰毁灭炮”的超级武器，其威力足以瞬间摧毁一整个星系。不仅如此，常规武器的火力也得到了大幅度提升，激光武器的能量输出增加了数倍，导弹的爆炸威力更是达到了前所未有的程度。

然而，暗物质联盟的反派们也没有闲着。他们疯狂地释放出一种新型的生物武器——暗物质魔虫。这些魔虫不仅具有强大的攻击力和防御力，还能够吞噬一切能量，使得联合舰队的武器效果大打折扣。

在初次遭遇暗物质魔虫时，联合舰队遭受了不小的损失。魔虫们迅速附着在战舰的表面，不断侵蚀舰体，导致多艘战舰失去了战斗能力。

但联合舰队并未被挫折击垮。他们立即组织科学家对魔虫进行研究，试图找到其弱点。经过紧张的实验和分析，科学家们发现魔虫对特定频率的声波极为敏感。

于是，联合舰队迅速为战舰安装了声波武器系统。当再次遭遇魔虫时，声波武器发挥了巨大的作用，魔虫们在声波的冲击下陷入了混乱，联合舰队趁机发动攻击，成功击退了魔虫的进攻。

然而，暗物质联盟的攻击愈发猛烈。他们派出了大量的战舰，配合着魔虫对联合舰队展开了全方位的攻击。

联合舰队在战斗中不断调整战术，利用先进的通讯系统和指挥策略，巧妙地将舰队分成多个战斗小组，从不同方向对敌人进行夹击。

在一次激烈的交锋中，联合舰队发现暗物质联盟的战舰似乎存在着能源供应的弱点。他们集中火力攻击敌人战舰的能源核心，成功使多艘敌舰失去动力。

但暗物质联盟迅速做出反应，他们派出了一种能够自我修复的新型战舰，给联合舰队的攻击带来了极大的阻碍。

联合舰队的战士们毫不气馁，他们继续在战斗中寻找敌人的破绽。经过长时间的艰苦战斗，联合舰队终于逐渐占据了上风。

就在联合舰队以为胜利在望时，暗物质联盟却使出了最后的杀手锏。他们启动了一种巨大的暗物质能量装置，试图引发一场宇宙级的灾难，将所有的一切都毁灭。

联合舰队立刻意识到了危险的严重性。他们迅速集结所有的力量，集中攻击暗物质能量装置。在这千钧一发的时刻，联合舰队的每一位战士都发挥出了超越极限的勇气和力量。

最终，在联合舰队的拼死抵抗下，他们成功摧毁了暗物质能量装置，彻底击败了暗物质联盟。

但战争带来的创伤是巨大的，许多星球被摧毁，生命消亡。联合舰队开始投身于宇宙的重建工作中。

他们利用先进的科技，帮助那些遭受重创的星球恢复生态平衡，重建文明。

在这个过程中，联合舰队也没有放松警惕。他们继续对生产线进行优化和升级，以防备可能出现的新威胁。

然而，宇宙的深处似乎总有未知的力量在涌动。一种神秘的信号引起了联合舰队的注意，这个信号似乎来自于一个遥远的星系，蕴含着未知的危险和机遇。