在战胜“暗影掠夺者”之后，联合舰队还没来得及休整，就又迎来了新的危机。宇宙中出现了一种被称为“末日魔兽”的恐怖生物，它们身形巨大，力量无穷，且具有强大的自我修复能力。

这些末日魔兽并非自然产生，而是由一种失控的生物科技实验所创造。它们在宇宙中横冲直撞，所到之处一片荒芜。

联合舰队立即展开行动，对这些末日魔兽进行研究。他们发现，这些生物体内有着复杂的基因变异结构，使其能够适应各种极端环境。

为了对抗这些强大的敌人，联合舰队进一步升级了他们的武器系统。开发出了一种能够发射特殊频率电磁波的武器，这种电磁波可以干扰末日魔兽的神经系统，使其行动变得迟缓。

在一次激烈的战斗中，联合舰队遭遇了一群末日魔兽的围攻。它们的攻击凶猛无比，联合舰队的战舰不断受损。

但战士们没有退缩，他们奋勇抵抗，利用新研发的武器暂时压制住了末日魔兽的进攻。

然而，就在战斗的关键时刻，末日魔兽发生了变异。它们的身体表面长出了坚硬的甲壳，能够抵御联合舰队的大部分攻击。

联合舰队的科学家们迅速分析这种变异，并对武器进行紧急调整。经过一番紧张的研究，他们发现了一种可以削弱末日魔兽甲壳强度的射线。

联合舰队立即将这种射线武器投入战斗，终于打破了末日魔兽的防御，再次占据了上风。

随着战斗的持续，联合舰队发现末日魔兽似乎在被某种神秘的力量操控。为了找出幕后黑手，联合舰队派出了一支精锐的侦查小队。

侦查小队在宇宙的深处发现了一个隐藏的实验室，里面充满了各种诡异的生物科技设备和实验样本。

经过深入调查，他们发现一个邪恶的科学组织正在利用末日魔兽来实现他们统治宇宙的野心。

联合舰队决定对这个科学组织的基地发动突袭。在激烈的战斗中，联合舰队成功摧毁了基地的核心设施，切断了对末日魔兽的控制。

失去控制的末日魔兽陷入了混乱，联合舰队趁机对它们展开了最后的围剿。