在成功击败“暗影帝国”并拯救宇宙维度之后，联合舰队成为了宇宙中当之无愧的英雄，但他们并没有因此而放松警惕。

在一次对遥远星系的探索中，联合舰队发现了一个神秘的行星。这颗行星的表面被一层奇异的光芒所笼罩，散发出强大而神秘的能量波动。

当舰队靠近这颗行星时，他们的仪器开始出现紊乱，仿佛受到了某种未知力量的干扰。联合舰队决定派遣一支先遣队登陆行星进行调查。

先遣队在行星上发现了一种古老的文明遗迹，遗迹中充满了复杂的符号和神秘的装置。在探索过程中，一名队员不小心触发了一个机关，释放出了一股强大的精神力量。

这股精神力量瞬间侵入了先遣队队员的脑海，让他们陷入了混乱和疯狂。联合舰队立刻展开救援，利用先进的精神防护技术，将队员们从崩溃的边缘拉了回来。

经过深入研究，联合舰队发现这个古老文明掌握了一种能够操控意识和情感的强大科技，但这种科技也因为过于危险而导致了文明的覆灭。

为了防止这种危险的科技落入不法之徒手中，联合舰队决定将其封印在这颗行星上，并设置了重重防护措施。

然而，他们的行动引起了一个神秘组织的注意。这个组织自称为“混沌使者”，他们一直在宇宙中寻找强大的力量来实现自己的野心。

“混沌使者”对联合舰队发起了一系列的袭击，试图夺取被封印的科技。联合舰队奋起抵抗，在一次次激烈的战斗中，逐渐揭露了“混沌使者”的真正目的。

原来，“混沌使者”计划利用这种意识操控科技控制整个宇宙的生命，建立一个绝对服从他们的黑暗帝国。

联合舰队深知不能让他们得逞，于是加快了对新型武器和防御系统的研发。他们开发出了一种名为“心灵屏障”的装置，可以有效抵御精神力量的攻击。

同时，联合舰队还与其他友好文明结成联盟，共同对抗“混沌使者”。在一场决定性的战役中，联合舰队与盟友们紧密配合，对“混沌使者”的总部发动了猛烈攻击。