在成功解决神秘舰队和病毒危机后，联合舰队继续在宇宙中穿梭，履行着守护和平的使命。

一次，他们在巡逻中发现了一颗被遗弃的星球。这颗星球上似乎曾经存在过高度发达的文明，但如今却一片荒芜，弥漫着神秘而诡异的气息。

联合舰队决定对其进行深入调查。当队员们踏上这颗星球时，他们发现这里到处都是破败的建筑和复杂的机械遗迹。通过对这些遗迹的研究，他们推测这个文明可能是因为一场可怕的实验而自我毁灭。

在探索过程中，舰队成员们遭遇了一系列奇异的现象。有时会突然出现强烈的能量波动，有时会听到莫名的声音在耳边回响。更令人惊讶的是，一些队员开始出现幻觉，仿佛被某种未知的力量影响了心智。

经过一番艰难的探索，联合舰队发现了一个隐藏在地下的巨大实验室。实验室中保存着一种强大的能量核心，其散发的能量波动与队员们所遭遇的异常现象密切相关。

然而，就在他们准备对能量核心进行研究时，一群来自宇宙深处的掠夺者突然降临。这些掠夺者觊觎能量核心的强大力量，企图将其抢走。

联合舰队立刻进入战斗状态，与掠夺者展开了激烈的交锋。掠夺者们拥有着先进的武器和诡异的战斗技巧，给联合舰队造成了不小的麻烦。

但联合舰队凭借着顽强的意志和紧密的配合，逐渐稳住了阵脚。在关键时刻，舰队的指挥官发现了掠夺者的指挥舰，并带领一支精锐小队发起了突袭。

经过一场惊心动魄的战斗，联合舰队成功摧毁了掠夺者的指挥舰，使其陷入混乱。最终，他们成功击退了掠夺者，保护了能量核心。

在对能量核心的进一步研究中，联合舰队发现它蕴含着能够改变宇宙能量结构的秘密。这个发现让他们既兴奋又担忧，因为如果这种力量被滥用，可能会给整个宇宙带来灾难。

为了确保能量核心的安全，联合舰队决定在这颗星球上建立一个秘密基地，并加强了周边的巡逻和防御。

与此同时，宇宙中的另一个角落，一种名为“暗影物质”的神秘力量开始蔓延。这种物质能够吞噬一切能量，并将其转化为黑暗力量。

联合舰队接到了相关的情报，开始着手研究对抗暗影物质的方法。他们发现，只有利用一种特殊的晶体才能中和暗影物质的影响。

于是，联合舰队展开了一场寻找特殊晶体的冒险。他们穿梭在各种危险的星系和神秘的遗迹中，遭遇了无数的挑战和阻碍。

在一个古老的星系中，联合舰队发现了晶体的线索。但这里存在着强大的守护者，他们不允许任何人带走晶体。

联合舰队不得不与守护者展开一场智慧与力量的较量。经过艰苦的谈判和战斗，他们最终获得了守护者的认可，成功得到了晶体。