黑暗的能量笼罩着他们，让他们陷入了困境。奥特曼们发射光线，试图打破黑暗的束缚，但效果甚微。那黑暗的力量仿佛有生命一般，不断地吸收着奥特曼们的光线，让他们的攻击变得徒劳无功。洪荒宇宙的生灵们施展法术，五彩斑斓的光芒在黑暗中闪烁，但也无法突破黑暗的屏障。漫威宇宙的超级英雄们则利用科技和超能力奋力抵抗，但也渐渐感到力不从心。

钢铁侠托尼·斯塔克发射出一道道激光，但那些激光在黑暗中瞬间消失，仿佛被黑暗吞噬了一般。美国队长史蒂夫·罗杰斯挥舞着盾牌，试图抵挡黑暗的侵蚀，但他的力量也在逐渐减弱。蜘蛛侠彼得·帕克在黑暗中荡着蛛丝，试图寻找出路，但他却发现自己陷入了一个无尽的黑暗迷宫。

就在联军陷入绝望之际，一道神秘的蓝色光芒突然出现。光芒中，一个熟悉的身影缓缓浮现。那身影高大而威严，散发着强大的能量波动，正是复活后的曼哈顿博士。他的身体由蓝色的能量组成，仿佛是一个活着的能量体。他的眼神深邃而冷漠，仿佛能看透一切。

曼哈顿博士的出现让联军们看到了希望。他们纷纷欢呼起来，仿佛在黑暗中看到了一丝曙光。曼哈顿博士看着暗影魔神，缓缓开口道：“暗影魔神，你的邪恶行径到此为止。”他的声音如同洪钟一般，在黑暗中回荡。

暗影魔神怒视着曼哈顿博士：“你是谁？竟敢阻挡我？”他的声音中充满了愤怒和不屑。

曼哈顿博士微微扬起下巴：“我是曼哈顿博士，宇宙的守护者。你的黑暗魔法在我面前将无所遁形。”他的话语中充满了自信和威严。

说罢，曼哈顿博士释放出强大的蓝色能量，那能量如同汹涌的海浪一般，向暗影魔神扑去。暗影魔神不甘示弱，他施展出黑暗魔法，一道道黑色的光芒与曼哈顿博士的蓝色能量碰撞在一起，发出巨大的声响。

联军们也趁机挣脱了黑暗的束缚，加入了战斗。奥特曼们发射出强大的光线，那光线如同利剑一般，划破黑暗的虚空。洪荒宇宙的生灵们施展强大的法术，五彩斑斓的光芒在黑暗中闪烁，如同烟花一般美丽。漫威宇宙的超级英雄们则利用科技和超能力全力攻击，钢铁侠托尼·斯塔克发射出一道道激光，美国队长史蒂夫·罗杰斯挥舞着盾牌，蜘蛛侠彼得·帕克在黑暗中荡着蛛丝，发射出一道道蛛丝。

在他们的共同努力下，暗影魔神渐渐陷入了困境。他的黑暗魔法在曼哈顿博士的蓝色能量和联军的攻击下逐渐失去了威力。然而，暗影魔神并不甘心失败，他施展出最后的杀手锏，黑暗混沌风暴。

风暴席卷而来，带着毁灭一切的力量。那风暴如同黑色的巨龙一般，在虚空中咆哮着。黑暗的能量不断地涌动，仿佛要将整个宇宙吞噬。

曼哈顿博士见状，双手一挥，一道巨大的蓝色能量护盾瞬间形成，抵挡黑暗混沌风暴。那护盾如同坚固的城墙一般，将风暴挡在了外面。联军们也纷纷施展自己的力量，加固护盾。奥特曼们将光线注入护盾，洪荒宇宙的生灵们将法术注入护盾，漫威宇宙的超级英雄们则利用科技和超能力为护盾提供能量。

在激烈的对抗中，曼哈顿博士找到了暗影魔神的破绽。他的眼神中闪过一道光芒，瞬间消失在原地。下一刻，他出现在暗影魔神的身后，发出一道强大的蓝色能量光束，击中了暗影魔神的要害。暗影魔神发出一声惨叫，身体逐渐消散。

随着暗影魔神的被击败，宇宙再次恢复了和平。奥特曼们、洪荒宇宙的生灵们和漫威宇宙的超级英雄们继续守护着宇宙的和平，他们对曼哈顿博士的复活充满了感激。而曼哈顿博士的出现，也为多元宇宙带来了新的希望。

在战斗结束后，联军们开始清理战场，修复被黑暗力量侵蚀的星球。奥特曼们用他们的光线力量净化着星球上的黑暗气息，洪荒宇宙的仙人们则用他们的法术恢复着星球的生机，漫威宇宙的超级英雄们则利用科技帮助星球上的居民重建家园。

曼哈顿博士看着这一切，心中充满了感慨。他知道，宇宙的和平是脆弱的，需要不断地守护。他决定继续留在宇宙中，守护着这片多元宇宙的和平与安宁。

在未来的日子里，多元宇宙将继续面临各种挑战和危机，但有了曼哈顿博士和联军们的守护，宇宙的和平将得以延续。他们将一起面对未知的敌人，为了宇宙的和平而战。