史前时期——千年前
在上古时代，一位女神降临
为忍者世界，带来了宇宙另一端的神秘力量——查克拉
这位女神名为大筒木辉夜，来自宇宙另一端的遥远星球。在那个星球上，居住着和她一样的人，他们有拥有这样的强大力量，被称为“大筒木一族”。
他们为得到力量，不惜在宇宙其他自然能量丰富的星球上“种树”，通过神树吸收自然能量，转化为他们需要的“查克拉”，神树一千年结一次果，果实成熟的时候，这个星球上的自然能量将被完全吸干，果实将被种树的人带回“大筒木一族”本家。
大筒木辉夜在对全地球的人类施展“无限月读”，所有人陷入沉睡，并被做成植物人军队，以免未来大筒木本家找她麻烦。
她的两个儿子无奈只好用自己的力量封印了辉夜，在天空中形成了一个巨大的球体，即月球。辉夜在死前留下了她的意志——黑绝，以便在未来上千年的时间中复活自己。
她的长子名为大筒木羽衣，次子名为大筒木羽村。两个儿子在封印母亲之后解开了无限月读，释放了全人类。羽村在封印母亲之后去往月球陪伴母亲，羽衣把神树的化身——十尾分成了九股较小的力量，即九只尾兽，被世人尊为“六道仙人”。
六道仙人在封印母亲后在地球上四处流浪，不再使用多余的力量。他与人类一起修行，与人类一起生活。在生活的过程中，为了避免十尾再次复活，他把查克拉分给了所有人，传递查克拉的修行方式，被称为“忍宗”。
许多年过去了，六道仙人有了两个儿子，长子名为因陀罗，次子名为阿修罗。因陀罗从小天赋异禀，很快领略到了查克拉的真谛，并开创了比“忍宗”更为效率的查克拉使用——“忍术”。
“忍术”通过一种特殊的手势——结印，把体内的查克拉以某种具像化的方式释放出来，释放出来的形态和性质因人而异，但也可以通过学习习得不同形态和性质的“忍术”。
忍术的性质分为：风、火、水、土、雷五种，被称为“遁术”。因陀罗也因此被称为“天才”。相比之下，阿修罗就显得逊色许多，他除了人缘好，在学习和修行方面几乎一无是处。
两个儿子都长大之后，六道仙人为了选继承人，让两个儿子分别去治理村庄。因陀罗仗着自己力量强大，一个人做完了所有工作就回了家。
阿修罗因为自己实力不足，与村民一起挖井劳作才取得了成功。当阿修罗回来时，还带了几个村民一起。
六道仙人看到村民们都很信服和喜欢阿修罗，便非常高兴，并派人去因陀罗治理的村庄视察。结果因陀罗的村庄里的人都不会自己劳动，还反过来怪罪帮他们做事的因陀罗。
六道仙人思考过后，决定废长立幼，把六道之力和忍宗全部托付给了阿修罗。因陀罗十分不满，杀掉了一直跟随在他身边的人以激发“万花筒写轮眼”的力量，与阿修罗大战了几天几夜没有结果。知道六道仙人快去世时，因陀罗到他身边说自己会轮回转世下去，总有一天会毁灭六道仙人创造的世界。
后来阿修罗得知之后，也向六道仙人承诺一定守护好忍宗，让兄长信服。
战国时代
元年前32年
木叶村建立三十多年前，大约元年前32年，森之千手一族和宇智波一族分别诞生了一个天赋异禀的小孩——千手柱间和宇智波斑。在这个充满战乱和仇杀的战国时代，大量平民甚至小孩也被卷入战争，忍者和国民的平均寿命只有30岁。
柱间的两个年幼的弟弟瓦间、板间在战场上被杀害。斑的家里原本也有五兄弟，但只剩下了泉奈一个弟弟。在相同的时代背景和成长环境下，两人诞生了相似的理想，命运牵引着两人相识相知。
柱间和斑小时候便在河边打水漂相识，在不透露姓氏的规则下他们成为最好的朋友，互相切磋忍术，畅谈人生理想。在残酷的战乱时代成长的两人，从小就立志成为强大的忍者，建立起能保护孩子们免受战争之苦的理想村落，彻底改变这个战乱的时代。
但是，背负着森之千手和宇智波命运的两人，不得不坚持家族的立场，兵刃相见。两个家族持续对立，互相厮杀，直到两人成长为各自家族的领导人。在两族对抗的过程中，宇智波一族逐渐陷入劣势，斑的弟弟宇智波泉奈也在战斗中被千手扉间用飞雷神斩重创，随后不治身亡。部分厌倦了战斗的宇智波族人开始投靠千手一族。渴望和平的柱间向宇智波一族发出了停战协议。但身为族长的斑因弟弟的死亡而被仇恨所支配，觉醒永恒万花筒写轮眼后向柱间发起了决斗，这便是第一次终结谷之战。
大战后柱间再次向身为族长的斑提出停战结盟的请求，斑被柱间求和的诚意所打动，争斗多年的宇智波一族和千手一族自此停战言和，结成联盟。
作品中并无“第一次终结谷之战”的说法，笔者将柱间和斑的对决与鸣人和佐助的对决前后对照，分别以一二三四次终结谷之战命名。
千手柱间和宇智波斑的生辰及享年均为不详，有两个时间点可以参考，一个是柱间长孙女纲手的生日，火影13年8月2日，漫画65卷动画586集《柱间与斑》中的回忆有柱间和纲手相处的场景，纲手还学柱间赌博。
以战乱时代高出生率高死亡率的标准，代差年龄理应在20-25年之间。那么柱间和斑大概在前37-前27年这个区间出生。折中取前32年，那么长孙女纲手出生时，柱间45岁抱孙是相当合理的。另一个时间点信息就是斑的弟弟宇智波泉奈享年24岁。泉奈逝世后，斑觉醒了永恒万花筒写轮眼，随后便爆发了第一次终结谷之战。战后千手与宇智波缔结同盟，尽管木叶村不是在一天就能建立起来，但泉奈的死亡时间都会向火影元年靠拢。以回忆时的人物形象来看，估算斑比弟弟泉奈大4~5岁。
活跃在元年前的忍者：
前32年10月23日，千手柱间出生
前32年12月24日，宇智波斑出生
前28年2月19日，千手扉间出生
前27年2月10日，宇智波泉奈出生
前24年3月7日，金角银角兄弟出生
前24年8月15日，角都出生
前16年5月20日，尾形胜人（主角原身）出生
仅罗列有具体依据可考究生辰的人物，无法合理推算具体年限的人物如初代及二代四影、猿飞佐助等则不标注。部分角色的婚前姓无从考究，使用婚后夫姓代替。
火影纪元
火影元年
柱间和斑在昔日玩耍的火之国森林深处的断崖下，建立起了新的村落。斑为村子取名木之叶忍者村。“木”指的是能使用木遁的千手柱间所代表的森之千手一族，“叶”指的是家纹为扇叶形状的宇智波一族。村子首领的名字由柱间命名“火影”，寓意为暗中保护火之国的忍者首领。
猿飞、志村、日向等大家族纷纷加入联盟，村子迅速壮大，成为火之国中最强大的组织。木叶村与期望领土安定的火之国取得合作后，形成了国家与村子地位对等的制度。
世人对木叶村的建立给予很高的评价，一国一村的制度被各国迅速效仿。雷之国-云隐村、土之国-岩隐村、水之国-雾隐村、风之国-砂隐村相继成立。不只是五大国，许多小国也纷纷成立忍者村。
木叶村成立后不久的火影2年，斑离开木叶村。
五大国忍者村初步建成后，在柱间的推动下，五大国忍者村首领进行了第一次五影会谈。千手柱间承诺将尾兽均衡分配给各大国忍者村，收受方以金钱作为回报，五大忍者村以此达成协议，国与国之间的纷争逐渐平息。
第一次五影会谈奠定了忍者世界进入“一国一村”时代后的基本格局，具有深远的历史意义。这次五影大会齐集了十位“影”级别的人物。
初代四影
四影护卫
尾兽的分配情况如下：
风之国·砂隐村：一尾守鹤（砂隐村原有）；
雷之国·云隐村：二尾又旅，八尾牛鬼；
水之国·雾隐村：三尾矶抚，六尾犀犬；
土之国·岩隐村：四尾孙悟空，五尾穆王；
泷之国·泷隐村：七尾重明；
火之国·木叶村：九尾九喇嘛。
火之国依靠尾兽交易所得到的金钱作为起步资金，投入木叶村的建设，培育高素质的忍者，接受各方任务委托，获取大量委托酬金，带动了国家的经济增长。火之国财政经费充足，又可以拨款用作军费支出，长期维持木叶村大量忍者作为国家军事力量，加上得天独厚的地理条件，火之国因此成为世界上综合实力最强的国家。
但是宇智波斑控制了九尾向柱间和木叶村发起了攻击。两人再次爆发更高级别的战斗，两人大战一天一夜，战斗惊天动地，大规模改变了地形，后人将两人战斗过的地方成为终末之谷，并在峡谷处建造了两人的雕像。
柱间为了守护当下和平的木叶村，杀死了曾经的挚友。之后柱间联合漩涡一族将九尾封印，以防尾兽再次被人操控利用，柱间的妻子漩涡水户成为第一任九尾人柱力。
漩涡一族是千手一族的远房血亲，家族成员擅长使用封印术。漩涡一族的族长漩涡芦名，凭借强大的实力建立了涡之国·涡潮忍者村。他能使用强大的封印术，被人们称作是木叶封印术的祖师。在初代火影千手柱间的努力下，涡潮村成为了木叶村的盟友。木叶忍者的制服上印有漩涡一族的标志，是两国世代友好关系的象征。
木叶草创
火影11年
为了确保教育稳定性和人才培养效率，千手扉间创办学校——木叶学堂，第一届有36名毕业生。此外，扉间还创建警务部队、暗部等木叶村大部分的机构。
二代火影千手扉间掌控木叶之初，便建立了木叶学堂、暗部、警务部队等机构（之后被其他一些忍者村效仿）。暗部，全名为暗杀战术特殊部队，类似于特种军队部门，暗部的成员都是从村子里筛选出的优秀忍者，主要进行保护影和预防敌人入侵忍者村的工作，另外还负责侦察敌情和暗杀等任务，任务的性质通常极其恶劣或枯燥，比如看守重要嫌犯等。由于任务的特殊性，暗部成员执行任务时都佩戴白色的动物面具，以代号相称。任务性质及其他一切资料均被视为机密。暗部由影直接统率，一切命令由影发布，部队底下设多个四人或五人分队，由分队长统一传达命令和领导执行任务。
出生于元年前5年的猿飞日斩、志村团藏、宇智波镜、水户门炎、转寝小春、秋道取风等人是木叶村培育的第一批人才，由于年代久远的关系，此处将他们称为“青铜一代”。
前11年10月8日大野木出生
前6年10月15日千代出生
前5年1月6日志村团藏出生
前5年2月8日猿飞日斩出生
前5年5月8日水户门炎出生
前5年9月1日转寝小春出生
前5年秋道取风、宇智波镜、猿飞琵琶湖出生
前4年1月26日海老藏出生
火影13年
在木叶村历史上刻下光荣名字的第二代人，“白银一代”诞生。代表人物是：“木叶白牙”旗木朔茂，“木叶三忍”纲手、大蛇丸、自来也，加藤断以及“铁血戴”迈特戴。
3年4月1日，三船出生
4年4月5日，达兹纳出生
7年10月4日，阿三老师出生
12年12月4日，加藤断出生
13年8月2日，纲手出生
13年9月3日，旗木朔茂出生
13年10月23日，土代出生
13年10月27日，大蛇丸出生
13年11月11日，自来也出生
13年12月10日，迈特戴出生
木叶三忍
银白色的头发，闪烁着白色光芒的特制查克拉短刀——这是“木叶白牙”在战场上让敌人闻风丧胆的形象，忍者们依据对手的形象特点辨别敌人身份，分析对手情报以及拟定作战策略。
木叶白牙
最初出现在回忆中的旗木朔茂，身着红色纹样短袖，与四代目波风水门的火影披风有相似之处。原作中关于“木叶白牙”的描述同样出自“黄色闪光”：“卡卡西的父亲是被称为“木叶白牙”的天才忍者，连传说中的三忍对他也要畏惧三分！”由于旗木朔茂在第二次忍界大战中有着更耀眼的战绩，“木叶白牙”的名号一度盖过同期的“木叶三忍”。
火影15年
最初只是独立教育部门的“木叶学堂”，加入军事及内政部门，培育具有战斗能力的忍者，正式定名为“忍者学校”。
忍界大战
初代火影千手柱间凭借着绝对实力终结了战国时代的纷争局面，开创了忍界新纪元。这是英雄主义的赞歌，也是时代呼唤变革的选择。在这基础上所建立的新时代平衡格局维系着新纪元最初十数年的和平。实际上各方势力安分守己，并非受制于当年会谈的一纸协议，而是碍于千手柱间在忍界的崇高威望。随着初代火影千手柱间离去，五大国之间的协议逐渐瓦解。
火影18年
云隐村率先发难，组织大批忍者入侵火之国，岩隐村与雾隐村也爆发战斗，第一次忍界大战爆发。木叶村对云隐村宣战，木叶青铜一代所组成的精锐部队是本次战争的主要主力。第二代火影千手扉间正是带领着精锐部队阻挡了云隐村大举侵略步伐。
人口稀少，土地贫瘠，经济羸弱的风之国在一战中没有过多描述，反而是二代目风影·沙门在砂隐村的发展上颇有建树。他将自古封印在寺院里的一尾守鹤纳入村子战力，致力于将尾兽军事化的研究。此外，他研发了一系列能够代替砂隐忍者的傀儡忍术，以及能够以少敌多、活用地利的磁遁忍术，沙门的强兵政策让砂隐村的军力有了划时代的发展，其所开发的傀儡术与磁遁术给砂隐村带来了深远的影响。
火影20年
随着战事的推进，云隐村内部开始分裂成主战派和议和派。以第二代雷影为首的议和派决定与木叶村停战结盟。
在结盟仪式上，金角银角兄弟率领部下突然发起政变，当场杀死二代雷影，并且击伤二代火影千手扉间。木叶势力趁乱逃离现场，不过遭到金角银角兄弟为首的精锐部队的追击。
二代目火影千手扉间在紧要关头考验了众人的大局观与行动力，然后独自去引开敌人掩护小队撤退，战死沙场。猿飞日斩受命成为第三代火影。
第一次忍界大战让各大国遭受巨大的损失，雷影、火影、水影、土影四位领袖都在第一次忍界大战中殒命。由于各大国均遭受巨大的战力损失并且丧失一号领导人，第一次忍界大战逐渐平息。
出生于前5年的宇智波镜享年25岁，可以确定他也是在火影20年的第一次忍界大战中牺牲。而二代目千手扉间的最后一役中宇智波镜也还在战场；
可以大致推算出：千手扉间，前28年-火影20年，享年48岁；宇智波镜，前5年-火影20年，25岁；金角银角，前24年-火影20年，终年44岁。
二代火影千手扉间、宇智波镜以及大蛇丸的父母均在第一次忍界大战牺牲。战后各国缔结了休战条约，世界迎来了将近20年的和平发展期。
幼年失去双亲的大蛇丸在父母墓碑前祭拜的时候发现了白蛇蜕去的蛇皮，从此与白蛇结缘。经历过数次战争引发出对生命的思考后，大蛇丸决心探索世间一切真理，解开所有忍术的秘密，以实现自己追求生命真谛的目标。
黄金时代
只要有树叶飞舞的地方
火就会燃烧
火的影子会照耀着村子
让新的树叶发芽
火影忍者主角团的父母一辈人出生于一战后安享和平的黄金年代。
火影19年-30年
19年8月16日，鼬和佐助的父亲宇智波富岳出生
21年6月1日，四代雷影·艾出生
21年8月10日，一乐拉面老板手打大叔出生
22年1月8日，雏田和宁次的父亲日向日足、日向日差兄弟出生
22年8月1日，五代水影亲信·青出生
23年8月9日，纲手弟弟绳树出生
24年3月22日，黑土父亲黄土出生
24年3月29日，我爱罗父亲罗砂出生
24年6月1日，佐助母亲宇智波美琴出生
24年11月11日，我爱罗母亲加瑠罗出生
25年9月7日，志乃的父亲油女志微出生
26年1月24日，井野父亲山中亥一出生
26年4月22日，丁次父亲秋道丁座出生
26年7月15日，鹿丸父亲奈良鹿久出生
27年1月25日，鸣人父亲波风水门出生
27年7月10日，鸣人母亲漩涡玖辛奈出生
28年2月24日，鹿丸母亲奈良吉野出生
29年8月12日，牙的母亲犬冢爪出生
30年3月5日，药师野乃宇出生
30年5月23日，我爱罗舅舅夜叉丸出生
以“黄色闪光”波风水门为代表的20后一代人，可称之为“黄金一代”。
这个时期是木叶村人才辈出的黄金年代。同时期的佼佼者涵盖了木叶八大家族的继承人，这些人日后全都成为了各自家族的族长，波风水门则从一众精英上忍中脱颖而出，以“黄色闪光”的威名横扫三战各大战场，年仅23岁便接任火影之位，成为木叶20后“黄金一代”的领军人物。
火影31年-火影35年
32年2月20日，弥彦出生
32年5月15日，奇拉比出生
32年9月19日，长门出生
32年11月8日，蝎出生
蝎和岸本同一天生日
33年2月20日，小南出生
33年7月4日，马基出生
33年8月28日，并足雷同出生
34年9月3日，山城青叶出生
火影33年，漩涡玖辛奈来到木叶村，成为第二任九尾人柱力，在忍者学校与波风水门相识，人送外号“血红辣椒”。
风云突变
由于国家间经济发展的不平衡导致经济差距加大，各国忍村武斗派势力抬头，以加大公平的特权为由，推行以武力来势力扩张，掠夺资源。平稳局势开始动荡，各国之间的矛盾逐步升级。
火影36年
纲手的弟弟绳树在任务中不慎误入陷阱，被爆炸符炸死，年仅12岁。
在外游历的自来也因为局势紧张被木叶村召回，各方势力剑拔弩张，酝酿着大规模的军事行动，战火一触即发。
火影37年
第二次忍界大战全面爆发。夹在土、风、火三大国中间的雨之国沦为主战场，多国忍者部队在雨之国境内交战，长年的战争给雨之国带来惨痛的灾难。雨之国平民身处战火中心地带，不可避免地被卷入战争，生命财产惨遭剥夺。弥彦、长门、小南的父母在战乱中身亡，三人成为流浪的孤儿。
雨隐村首领山椒鱼半藏向入侵雨之国的大国宣战，火之国和风之国、雷之国和土之国在多个战场激烈交战，第二次忍界大战进入白热化阶段。
二战中，千代的毒被纲手破解，蝎的父母被旗木朔茂击杀，“木叶白牙”的称号闻名忍界，木叶和砂隐的战争以木叶的胜利告终。
火影39年
在雨隐村战场，站在忍界顶点，被称为“半神”的山椒鱼半藏在成功压制住木叶精英战力自来也、大蛇丸和纲手，但面对木叶在多方面战场的优势，他预见战争将以木叶村的胜利告终，于是他选择主动结束争斗，赐予他们“木叶三忍”的称号。
在和雨隐主力的战斗结束后不久，自来也遇到弥彦、小南、长门三个战争孤儿，抱着弥补战争创伤的期望，独自留下照顾他们。
火影40年
纲手恋人加藤断在战争中身受重伤，不治身亡。经此一役，纲手罹患恐血症。第二次忍界大战亦逐渐进入尾声。
加藤断，火影12年12月4日-40年，终年27岁。第二次忍界大战带走了纲手一生中最重要两个人的生命，目睹了断死亡惨状的纲手遭受巨大打击，身为医疗忍者的纲手却患上了最棘手的恐血症。
火影41年
云隐村为了将尾兽用于军事用途，不断地进行尾兽试验。但由于人柱力未能完全控制尾兽，八尾多次暴走，对云隐村造成巨大破坏，每次制止失控的八尾都会出现众多的伤亡。为了能够完美地操控尾兽，云隐亟需掌握压制尾兽查克拉的方法。