文思院负责金银铜货币及器物的铸造；

铁器局负责除金银铜其他金属的冶炼和铸造；

军器局负责军事武器的制造与维护；

织染局负责布料的生产和织染；

水利局负责各种水利工程设施的建设和管理；

矿务局负责各种矿物的开采提炼；

道桥局负责道路桥梁的规划建设；

营缮局负责房屋、城墙等大型工程的规划建设；

马政局负责马匹牲畜的饲养和管理；

农政局负责农事管理和农业技术的改进；

竹木局负责竹木薪炭的生产运输分配；

杂造局负责其他生活用品的生产制造。

在天启六年五月六日，王恭厂大爆炸，北京西南隅被夷为平地，炸毁房屋两万多间，死伤两万余人。灾难惨状历历在目。

考虑到安全问题，工部改革前，朱由校就命令徐光启在京师外重新择址，兴建新厂房，改名为“安民厂”，把王恭厂整体搬迁过去，远离居民区。

安民厂新址位于京师西南方向的良乡县小清河旁边，占地两万三千亩，包含了火药科、铳炮科、弓弩科、甲胄科、兵杖科、鞍鞯科、杂作科等等。

现在的工部，徐光启任尚书统筹整个工部各项事务；吴淳夫任左侍郎，但朱由校严令他不得插手工部具体事务，只负责应对其他各部官员，和东林党扯皮，去户部争财政预算什么的；毕懋康任右侍郎，主管军器局，并实际负责火药科和铳炮科。

三月十日，朱由校亲临安民厂视察，工部尚书徐光启、右侍郎毕懋康、军器局郎中孙元化、铳炮科主事张焘随同。

安民厂东临小清河，防火级别最严格的火药科和铳炮科就建在小清河旁，方便随时取水。

朱由校巡视了安民厂，最后又重点巡视了火药科和铳炮科，对随同的臣子道：

“各位卿家，未来的战争必定是以火器为主导，刀枪剑戟会逐步淘汰。军器局肩上背负的就是整个大明的命运，未来大明是龟缩防守当孙子还是开疆拓土做大爷，就看尔等把火器发展到何种地步了！”

朱由校看向徐光启：

“朕已下旨许以高薪厚禄，召集天下匠人，云集京师供工部选拔聘用。人才是发展的第一动力，徐爱卿要好好珍惜利用，不要吝惜钱财，户部给的预算不够，内帑会全力支持你的。

工部全员要立志创新、锐意改进、勇于实践、敢于验证。徐爱卿拟个章程出来，针对工部各局、各科工匠的薪酬俸禄以及创新建议的嘉奖，直接呈给朕，无须经过内阁。”

“臣领旨！”

朱由校看向孙元化：

“孙卿家兼任神机营左军总兵，以后军器局新产的火器便先交由你部使用如何？”

孙元化咧嘴笑道：“臣领旨！谢陛下恩典！”

最后又对毕懋康和张焘道：

“毕卿家和张卿家是火器上的专家，要多多留意底下人的意见，集思广益，也要参考前人的成果，如万历年间中书舍人赵士桢的《神器谱》，实践出真知，多做试验，争取早日造出更先进、更可靠的火器，让我大明将士消灭外敌，保国安民呀！”

“臣领旨！”

三月十五日，朱由校下旨，太医院下设立“太医学院”。

聘任陈实功为院长，张景岳为副院长，吴又可、傅青主为教授，广招各地大夫、郎中为讲师，收授幼童幼女入学。

戊辰年医科全部进士、举人和监生调入太医院，为逐步建立大明医学体系，打造医疗系统作人才储备。

十六日，太医院下设“女医署”。魏忠贤在宫中挑选了三千名宫娥进入太医学院培训学习，成为首批“医女”，开始建立随军医疗队。

十八日，国子监下设“太学院”，太学院分“国学”和“科学”两院。

国学院教授传统的四书五经、读书认字；科学院则教授算、农、军、律等多种学科，聘任李之藻为院长，王徵为副院长，戊辰年算、农、军、律四科进士、举人、监生皆调入科学院，为逐步建立大明的科学教育体系作准备。