更让于琛瀓不省心的是两个儿子。于琛瀓一生共娶了四房妻室，两个儿子皆为二太太所生。为了光宗耀祖，于琛瀓先把大儿子送到英国留学。这个儿子还算争气，取得了经济学硕士学位，可惜学业有成身体却垮掉了，成了一个废人，只好回双城老家过着清闲的日子。

二儿子于经遇，是个典型的花花公子。于琛瀓知道二儿子的德行，就把他送到日本陆军士官学校。于经遇根本就经受不了训练之苦，没几天就退学，在东京过上花天酒地的糜乱生活。东京玩腻了，就偷偷回到哈尔滨，在马迭尔宾馆包了个高级房间，每天歌舞升平、眠花宿柳的。于琛瀓得知消息后，派手下人把儿子弄回家，好生教训了一顿。可他重新在警察局工作没多少时日，就患喉癌死掉了。

“9·18”事变爆发，吉林高官熙洽开城纳敌，为拼凑伪政权，熙洽派人找到于琛瀓，动员他再次出山。经熙洽的引见，于琛瀓结识了关东军第二师团长多门，被任命为北满讨伐总司令，兼北满护路军司令。伪满洲国成立后，他又被授予上将军衔。于琛瀓从一个下野的旧军阀摇身变成称霸一方、兵权在握的实权人物，就更加玩命地效忠日本人，竟逐渐爬上了第一军管区司令和伪三江省高官治安部大臣的高位。1936年，他率伪军对抗日联军进行了长达一年半的大讨伐，其间，实行集团部落和联保制度，割断老百姓与抗日联军的联系，围剿并杀害许许多多抗日志士和无辜的百姓，双手沾满了国人的鲜血，可谓罄竹难书。

1935年秋，于琛瀓到日本参观，日本天皇授给他一枚菊花大勋章。日本最高军事参议官荒木贞夫赠送给他一把宝剑。日本关东军司令官本庄繁赠他一套日本和服。于琛瀓有了日本这些高官的抬举，回国后更加有恃无恐，已不再满足治安部大臣的位置，一心想取代张景惠出任伪满洲国总理。

1943年，正当于琛瀓躺在自家豪华公馆的沙发床上做着总理梦时，一纸任命书将他拉回现实。伪满洲国皇帝为表彰他，特授予他“将军”称号，并任命他为“军事咨议官”一职，这个“将军”称号相当于“元帅”。当时，伪满洲国没有设元帅衔，咨议官实际上是个没有实权的闲职，表面上看于琛瀓是受到了重用，实际上被剥夺了治安部大臣的位子。

当时外界议论：于琛瀓被罢官是因为他想要当总理，而得罪了张景惠。张景惠借日本人之手剪除了竞争者。还有人说，他酒后无德，一次到吉林公干时在宴会上醉酒，把上衣脱光还用两腿夹着个酒瓶子来挑逗艺妓，关东军司令官大为光火，认为他的行为“过于轻佻”。其实，导致于琛瀓下台的直接原因是，日本人占领香港后，发现于琛瀓在香港的英国汇丰银行和美国花旗银行存有巨款，由此不再重用，只给他弄了个闲职装点门面而已。

他的公馆也由过去“座上客常满，壶内酒不空”，变得门前冷落鞍马稀了。

即使这样，日本人仍对他十分警惕，以时局紧张为名，派警察和日本宪兵守在他家门口，对他实行软禁。

1945年6月，当他从广播中得知重庆国民党政府将他列入甲级战饭名单后，顿时七窍流血，暴毙身亡。