崇祯四年十二月，洪承畴调集各路兵马直扑庆阳府的环县，首先剿讨围攻环县的黄友才部。此时神一魁集团经过内部分裂，黄友才手下只有万把人，很快就被打得土崩瓦解了，黄友才也在突围时被明军用火铳干死。此战，明军光斩获的首级就多达一千一百多个。
解决了黄友才之后，老洪马上转兵去攻打“红军友”、“李都司”、“杜三”、“杨老柴”这一帮“小喽啰”。这一路人马自打和黄友才决裂以后，便一路向南跑到了庆阳府境内。这支队伍足有四万多人，加上随军的家属，总数已不下十万人。可谓是人多势众、声势浩大，但粮草的消耗也同样巨大。此时的陕西境内连年灾荒，又兵荒马乱，早就没粮可抢了，要抢粮只能去攻打城市。而且县城还不够，喂不饱这么多人，必须攻下大一些的城市才行。因此这一路人马就开始围攻庆阳府，指望着攻下府城能吃饱肚子。庆阳府守军不多，被这么多“流寇”围城，急得团团转。千钧一发之际，洪承畴的援军来了。
崇祯五年（1632年）二月，洪承畴亲率大军一路疾进，只用了短短四天就走了五百余里，突然出现在了庆阳府外围。义军和官军刚一交战，就被曹文诏的骑兵冲得七零八落，一败涂地。“红军友”、“李都司”、“杜三”、“杨老柴”几个头目见势不妙，扔下随军家属和辎重，带着精兵赶紧跑路。而曹文诏率领麾下的骑兵一路猛追猛打，将“红军友”他们几个追得筋疲力尽，怀疑人生。就这么着被曹文诏撵鸭子一般撵了十来天之后，义军已经是又饥又累、军心涣散，大批士兵撒丫子跑路去了，队伍也就只剩下万把人了。
到了三月中旬，明军追击到镇原县西濠村，开始对义军发起总攻。没错儿，这一战毫无悬念，义军大败。“杜三”、“杨老柴”被捉去砍了脑袋，“红军友”、“李都司”侥幸逃脱。此时，他们的手下只剩下了千把号人。
曹文诏自然是不肯放过他们，他要扩大战果。在老曹的持续加压之下，义军内部终于发生内讧，一部分首领决定向老曹投降。他们砍了“红军友”的脑袋献给了曹文诏，但依然难逃一死。而“李都司”再次侥幸逃脱。眼看着弟兄们大部分都“死翘翘”了，“李都司”心里也在此时变得哇凉哇凉的了。他在经过一番心理斗争之后，决心报仇雪恨，宰了老曹这个王八蛋。但问题是现在自己的手下只剩下区区几百人，拿什么实力去跟老曹这员悍将对抗啊。于是乎，他便跑去联络各路英雄豪杰，请求大家一起联手干掉老曹这个“刽子手”。而此时的老曹已是“名声在外”、“声名远播”，各路的“流寇”们也都知道了老曹手段的厉害，谁敢触碰他的底线那就得脑袋搬家。只有大家联起手来干掉这个杀人魔王，大家才可能有活路。经过一番权衡利弊，本来就是是一盘散沙、各自为战的各路义军竟然破天荒地决定来一次“三军”联合作战。
而在此时，跑去山西的流寇“不沾泥”张存孟又从山西跑回了陕西，大旗一树，很快又招揽了上万的饥民，开始进攻米脂、葭州（今陕西佳县）。东线告急，洪承畴马上挥军东返去迎击张存孟，西线这边就交给了曹文诏来处理。
“李都司”等各路人马认为，为兄弟们“报仇”的时机到了。
这年五月间，“李都司”联合了“可天飞”、“郝临庵”、“刘六”、“独行狼”等几路义军，总兵力不下数万人，他们决心对曹文诏进行一次“包饺子”。他们首先出兵围攻合水县（今甘肃合水县），以引诱曹文诏前来救援，来他个“攻其所必救”。主力则都埋伏在合水以南的群山中。这老曹一听说合水被“流寇”围攻，立马指挥部队去增援。而义军刚一交战便迅速败走，老曹对“流寇”们已经是赢麻了的状态，根本不知道他们竟然还会使用“诱敌深入”的战术，直接一路闯进了义军的伏击圈。此时，附近的山头上数万义军奔涌而下，将曹文诏的人马给团团围住了。《孙子兵法》所言：“十则围之，五则攻之，倍则分之”。这批“流寇”拥有了多于老曹十余倍的兵力，又抢占了有利地形。所以说，大家也满怀信心地认为：这次老曹的脑袋铁定是要搬家了。
不成想，老曹这人可不是一般的人物。他眼看着自己部队被围，却纹丝不乱，大有“百万军中取上将首级”的心态。他亲自持矛跃马，来回反复冲击包围圈。“曹”字帅旗所到之处，义军们纷纷倒下。他手下的人看着老曹如此勇猛，顿时士气大振。在老曹的精心指挥下，义军队伍最终全面崩盘，士兵跑得漫山遍野，被曹文诏的骑兵追着屠杀。此战，义军尸横遍野，阵亡者不下万人。大家精心谋划的战术竟然被老曹给来了个“反杀”。
事已至此，能有啥办法能解决困局？对一群食不果腹的农民军来说，答案是否定的。
五月间，洪承畴彻底打垮了张存孟，老张也被捉去砍了脑袋。紧接着老洪在东线，曹文诏在西线，两边儿同时对进，逐渐把残存的义军队伍压缩到了宁塞、安边、定边以南，庆阳、合水、环县以北的狭长地域内。这个区域人烟稀少、土地贫瘠、粮草不济，残存的数万义军根本无法获得足够的补给。时间久了，这些士兵们个个是士气低落、惶惶不可终日。
老洪老谋深算，自然也就知道义军们现在正处于穷途末路的境地。因此，他果断抓住此良机，在义军内部大搞策反。在他的威逼利诱之下，义军的队伍里很快就拉出来一大帮出来“投诚”的二五仔。在这些二五仔们的帮助下，到了十月间，老洪终于攻破了义军防守的最后一个据点。“李都司”、“可天飞”、“郝临庵”、“刘六”、“独行狼”等义军首领不是被明军剁了脑袋，就是被自己手下的二五仔给捅死了。一时之间，这里变成了人间地狱。要说老洪真是无愧于“洪剃头”这个名号：他将五十八颗义军首领的脑袋送到庆阳府城，挂在城墙上示众；又把一千多被杀的义军士兵的脑袋砍下来，做成“京观”，以吓唬那些胆敢反抗的屁民们；到最后，老洪还背信弃义地将已经投降的四百多义军士兵给活埋了。心狠手辣者，莫过老洪也。
崇祯五年十一月，老洪出任三边总督仅仅一年时间，陕西境内的“流寇”基本就被他给清剿完了。这一年内被他杀掉的义军起码有十几万人，如果再加上被无辜屠戮的百姓，总数可能有数十万之众。
而在陕西的一墙之隔的山西境内，义军队伍却在不断发展壮大，他们没多久就开始挺进中原了……