崔莹的南征虽然取得了胜利，但也引发了一些争议。王禑认为，如果崔莹没有率军南征，恭愍王或许不会遇害。尽管如此，崔莹的军事才能仍然得到了认可。洪武八年（1375年），崔莹被任命为判三司事，与庆复兴（庆千兴）、李仁任、池奫等重臣共同辅佐年幼的王禑。与此同时，他还要与李成桂一起领兵防备倭寇的侵扰。

洪武九年（1376年）七月，倭寇在连山开泰寺击败高丽军，元帅朴仁桂战死。得知这一消息后，崔莹主动请缨出战。尽管王禑担心崔莹年过六十，身体状况不适合领兵，但崔莹表示：“小小的倭寇如此横行霸道，现在不制伏，以后必然难以控制。如果派其他将领，未必能赢，而且士兵不上战场试试身手，也不能用。臣虽然年老，但志气不衰，只是想安定宗社、保卫王室，愿马上率麾下将士去击退他们！”在崔莹的再三请求下，王禑终于同意了他的请求。崔莹当天就出发，不久在杨广道鸿山（今韩国忠清南道扶余郡鸿山面）遭遇倭寇。他先占据有利地形，然后身先士卒，与倭寇激战。即使嘴唇中箭，崔莹也神色自若，最终力克倭寇，于八月凯旋开京。王禑打算任命崔莹为百官之首——门下侍中，但崔莹表示一旦当上侍中，就不能挂帅出征，希望等到倭寇平息后再考虑。于是，王禑封他为铁原府院君，以表彰他的功绩。

宣光七年（1377年，洪武十年）春，高丽朝廷内部发生了一场政治斗争。李仁任与池奫之间的矛盾日益激化，最终导致池奫被诛杀。崔莹站在李仁任一边，参与了这场政变。事后，崔莹感到非常惭愧，便以年老多病为由请求辞职，但王禑没有同意。同年，倭寇再次骚扰江华岛一带，崔莹以都统使的身份坐镇升天府（今朝鲜黄海北道开丰郡），负责防御倭寇。他与边安烈联手击退了入侵西江的倭船，再次证明了自己的军事才能。王禑曾考虑将首都迁至内地以避开倭寇的侵扰，但遭到崔莹的反对，最终放弃了这一计划。同年九月，崔莹又成功击退了入侵海、平两州的倭寇。

宣光八年（1378年）四月，倭寇再次大举入侵，船只云集窄梁，攻入升天府，逼近开京。崔莹领兵至海丰郡，表示：“社稷存亡，决此一战！”倭寇全力进攻，崔莹一度败走，但李成桂率骑兵与副帅杨伯渊大破倭寇。崔莹听说后，整兵从旁反击，最终将倭寇击退。王禑授予崔莹“安社功臣”号，以表彰他在保卫国家方面的杰出贡献。同年，倭寇入侵全罗道，郑地在顺天、兆阳战败。崔莹请求出征，但在即将出发时，王禑认为“不可重内而轻外”，决定将他留在开京，由李成桂、边安烈挂帅出征。结果，李成桂取得了荒山大捷，崔莹亲率百官前往东郊天寿寺迎接凯旋的将士，挥泪称赞“三韩再造，在此一举”，倭患从此逐渐平息。

洪武十三年（1380年）四月，崔莹兼任海道都统使，出屯东、西江以备倭。王禑赐给他铁券，允许他犯罪九次免于处罚，直至第十次才治罪并减一等，这一特权还延及子孙。同年秋天，倭寇侵犯高丽南方内陆，崔莹率诸将进剿。但在临行前，王禑再次下旨将他留下，由李成桂、边安烈挂帅出征。最终，李成桂在荒山大捷中取得了决定性胜利，崔莹亲率百官迎接凯旋的将士，表达了对李成桂及其部队的高度赞扬。

五、执掌大权

洪武十四年（1381年）二月，崔莹被任命为守侍中，地位仅次于门下侍中李仁任，成为高丽朝廷中仅次于首相的二号人物。这一任命标志着崔莹在政治舞台上的地位进一步提升，显示了王禑对他的高度信任和重视。然而，崔莹并没有长期担任这一要职。翌年六月，他主动辞职，改任领三司事，虽然不再直接参与日常政务，但仍保留了重要的顾问角色。

洪武十七年（1384年），崔莹再次被任命为判门下府事，九月正式升任门下侍中，成为高丽朝廷的实际领导人。然而，崔莹上任后不久就以身体不适为由请辞，并上缴了海道都统使之印，请求解除兵权。这一举动表明他可能意识到自己年事已高，不希望再承担过多的军事责任。王禑派知申事廉廷秀前来慰问，劝说崔莹继续留任。在廉廷秀的劝说下，崔莹勉强回到了都评议使司（都堂）视事，执掌大权。

在担任门下侍中的两个月期间，崔莹展现出了高度的责任感和正直的品格。他经常直言不讳地批评王禑的一些荒淫行为，尽管这些批评可能会引起王禑的不满，但王禑总是优待包容崔莹，不予责怪。这不仅体现了王禑对崔莹的尊重，也反映了崔莹在高丽朝堂上的崇高地位和广泛影响力。

然而，崔莹的首相之路并非一帆风顺。洪武十七年（1384年）末，他再次退居闲职，改任判门下府事，由林坚味接替门下侍中的职位。尽管退居二线，但崔莹作为“先王所倚重，三韩所属望”的元老大臣，依然在朝廷中具有举足轻重的地位。他的意见和建议仍然对高丽的政局产生着深远的影响。

洪武二十一年（1388年）正月，王禑对林坚味、廉兴邦一伙的不满达到了顶点。为了清除这些权臣，王禑命令崔莹和李成桂联手除掉林坚味、廉兴邦一党。崔莹再次出任门下侍中，执掌国政，而李成桂则担任守侍中。在这次政治清洗中，崔莹大兴诛戮，甚至有滥杀之嫌。例如，任献是一位清官，但崔莹认为他是廉兴邦的同党，且在大司宪任上未发一句直言，便将其斩首，时人为之悲哀。这一行为虽然达到了清除政敌的目的，但也引发了人们对崔莹的质疑和批评。

另一方面，李仁任虽然是林坚味、廉兴邦一党的后台，但之前与崔莹关系密切，并且曾阻止过林坚味等人除掉崔莹的图谋。因此，林坚味被捕前曾叹息“广平君误我矣！”崔莹最终放过了李仁任，仅将其流放至京山府（今韩国庆尚北道星州郡）。崔莹解释说李仁任“功可掩过”，这一决定虽然在一定程度上维护了政治平衡，但也被人诟病为“正直崔公，私活老贼”。

六、失势身死

洪武二十一年（1388年），崔莹刚刚就任门下侍中不久，就面临了一个极其棘手的问题：宗主国明朝宣布设立铁岭卫。高丽方面认为，这是明朝意图恢复元朝时期的双城总管府，迫使高丽割让北部大片领土。面对这一威胁，崔莹采取了强硬的立场，劝说王禑趁机出兵侵犯明朝的定辽卫。王禑采纳了崔莹的建议，于同年四月任命崔莹为八道都统使，与自己一同坐镇后方，由李成桂和曹敏修负责领兵攻辽。此外，崔莹还派遣裴厚前往北元，企图联合北元共同夹击明朝。对于前线将领的班师请求，崔莹坚决拒绝，要求他们继续执行攻辽任务。

然而，这一决策最终导致了高丽内部的严重分裂。同年五月，在李成桂的主导下，高丽北伐大军在鸭绿江心的威化岛发生了哗变。军队掉头攻击王禑和崔莹，史称“威化岛回军”。王禑和崔莹仓皇逃回开京。六月，李成桂和曹敏修率领叛军包围了开京，上书请求除掉崔莹。王禑虽然不愿意，但迫于形势，不得不任命崔莹为门下左侍中。然而，这并未平息叛军的怒火，诸军继续攻城。崔莹派兵迎战，但未能成功，最终不得不躲进花园的八角殿。最终，崔莹被郭忠辅等士兵逮捕，起初被流放至高峰（今韩国京畿道高阳市），不久后改为流放合浦（今韩国庆尚南道昌原市）。

七月，王禑的弟弟王昌继位，成为新的高丽国王。新王上台后，崔莹再次被逮捕，关押在巡军狱中接受审问。随后，他被流放至忠州。十一月，崔莹再次被关押在巡军狱中。典法司（原刑部）和台谏强烈要求处死崔莹，以平息明朝的怒火。十二月，崔莹被判处死刑，斩首示众，享年七十三岁。临刑时，崔莹辞色不变，表现出了一位老臣的从容和尊严。开京市民在行刑当天罢市，街头巷尾的男女老少纷纷流泪，表达对崔莹的哀悼。崔莹的尸体被丢弃在道路旁边，但过往的行人纷纷下马致敬，都评议使司还赐给崔莹家属米、豆、布、纸等物资，帮助他们办理后事。

崔莹的死标志着他在高丽政治舞台上的终结。尽管他在军事和政治上曾立下赫赫战功，但最终还是因政治斗争和外部压力而落得悲剧性的结局。他的忠诚和勇敢为后人所敬仰，但他的强硬政策和决策失误也给他带来了致命的打击。朝鲜王朝建立后，李成桂于洪武二十九年（1396年）十月命令奉常寺为崔莹拟定谥号，最终赠谥“武愍”。